Buenas tardes amigos primero que nada los saludo desde venezuela tengo un wisp instalado y estoy montando un servidor  sobre este hardware:

Placa base asus con 2 procesadores opteron de 2.4ghz dualcore y 12gb de ram (a espera de 4gb mas).

En este equipo instale windows server 2008 r2 y corro una vmware con mikrotik y raptor cache las configuraciones son un exito y este equipo me ha trabajado bien con 50 usuarios conectados simultaneamente, ahora mi duda es con los discos duro.

discos que dispongo para esta maquina.

wd sata            80gb
wd sata            1tb
wd elements usb 3tb
seagate sata      3tb
scsi                  20gb

Ya que dispongo de un disco SCSI no se si me conviene mas instalar todo el sistema en ese disco o dejarlo en el SATA

Otra cosa la maquina tiene soporte RAID 0, 1, 0+1 aqui si es verdad que no se para que me pueda servir

actualmente esta de esta manera.
sata 80gb para sistema operativo
sata 1tb  para cache

y el sata 3tb esta en un dispositivo NAS zyxel nsa325, este mismo hace streaming de audio y video. (que me parece mucho para esto)